RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552620.1

CHMP4A-210, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 716 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-210ENST00000552620 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 LCE2CQ5TA81 110 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 OLFM4Q6UX06 510 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 TMTC2Q8N394 836 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 NXPE3Q969Y0 559 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 ALG1Q9BT22 464 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 KRT23Q9C075 422 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 ATRNO75882 1429 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 PAPPAQ13219 1627 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM177BA6PVY3 158 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 NFKBIEO00221 500 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 ZBTB43O43298 467 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 PDE8AO60658 829 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 TRPA1O75762 1119 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 PDE8BO95263 885 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 SMC2O95347 1197 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 PFKFB1P16118 471 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 MCAMP43121 646 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 RCAN1P53805 252 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 PPP2R5BQ15173 497 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 PTPAQ15257 358 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 RESP18Q5W5W9 173 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 KRT40Q6A162 431 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 NBPF11Q86T75 865 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 NLRP10Q86W26 655 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 LPIN2Q92539 896 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 TNFRSF25Q93038 417 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM89AQ96GI7 184 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 GMLQ99445 158 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 SPON2Q9BUD6 331 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 IFNKQ9P0W0 207 aa6.84□□□□□ -1.31
CHMP4A-210ENST00000552620 NEDD4P46934 1319 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 METTL12A8MUP2 240 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 KIF28PB7ZC32 967 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 WIPF1O43516 503 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 FBXO24O75426 580 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 APPP05067 770 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 ARAFP10398 606 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 IFNAR1P17181 557 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 ADH6P28332 368 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 GJA8P48165 433 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 CTSWP56202 376 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 UBASH3AP57075 661 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 CBX1P83916 185 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 ATP11AP98196 1134 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 MYL5Q02045 173 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 MAP3K12Q12852 859 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 NTRK3Q16288 839 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 KANK3Q6NY19 840 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 APOA5Q6Q788 366 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 BRINP3Q76B58 766 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 TMC6Q7Z403 805 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM35AQ86V20 835 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 MLKLQ8NB16 471 aa6.83□□□□□ -1.32
CHMP4A-210ENST00000552620 IRF7Q92985 503 aa6.83□□□□□ -1.32
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