RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PIM2Q9P1W9 311 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRB-208ENST00000550358 COL15A1P39059 1388 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRB-208ENST00000550358 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRB-208ENST00000550358 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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