RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540382.5

ARL6IP4-217, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

TSL 5

Gene ARL6IP4, Length 1,677 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-217	ENST00000540382	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	EDNRB	P24530	442 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	SLC39A14	Q15043	492 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	USP6NL	Q92738	828 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	TRIM47	Q96LD4	638 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	FAM86B1	E9PN63	330 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	CEP55	Q53EZ4	464 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	SPATA32	Q96LK8	384 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	FIBP	O43427	364 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	NEMF	O60524	1076 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	STAM2	O75886	525 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	HOXC6	P09630	235 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	STK38	Q15208	465 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382		Q4G0T1	1027 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	PTGDR	Q13258	359 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MORC4	Q8TE76	937 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ARL6IP4-217	ENST00000540382	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ASB14	A6NK59	587 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MEIS1	O00470	390 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	LAD1	O00515	517 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	SLC37A4	O43826	429 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	STXBP2	Q15833	593 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	PRR16	Q569H4	304 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	LENG9	Q96B70	501 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	PCNT	O95613	3336 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	SPTLC2	O15270	562 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	FKTN	O75072	461 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ITGB5	P18084	799 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	RGS2	P41220	211 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	PDE4D	Q08499	809 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	POTED	Q86YR6	584 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MAML3	Q96JK9	1138 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	JADE2	Q9NQC1	790 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	PPP6R2	O75170	966 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ERO1A	Q96HE7	468 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ELP1	O95163	1332 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	CALCRL	Q16602	461 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MTMR9	Q96QG7	549 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	TBX3	O15119	743 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	CAP1	Q01518	475 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	JMY	Q8N9B5	988 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	GNRH1	P01148	92 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	OR52Z1	P0C646	297 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	PRPH	P41219	470 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	NLRX1	Q86UT6	975 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	GPRASP2	Q96D09	838 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	APBA2	Q99767	749 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MCM3AP	O60318	1980 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MAFG	O15525	162 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	CYP2B6	P20813	491 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ARHGEF6	Q15052	776 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ARMCX2	Q7L311	632 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	RGS20	O76081	388 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	HOXD10	P28358	340 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	MTMR1	Q13613	665 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARL6IP4-217	ENST00000540382	HAS1	Q92839	578 aa		28.83	■■■□□ 2.21

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