RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF536O15090 1300 aa22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TDP2O95551 362 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.235e-7■■□□□ 14.5
PACSIN3-211ENST00000539589 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 USP14P54578 494 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 VGLL4Q14135 290 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 NELFBQ8WX92 580 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D5Q92609 795 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB34Q9BZG1 259 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TMX1Q9H3N1 280 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K9P80192 1104 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CDCA5Q96FF9 252 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC37A4O43826 429 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 HMGCS2P54868 508 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPN21Q16825 1174 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP135Q66GS9 1140 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 ANO3Q9BYT9 981 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOBTB3O94955 611 aa22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 PRCPP42785 496 aa22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 AMPD3Q01432 767 aa22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 LDHDQ86WU2 507 aa22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 GDAQ9Y2T3 454 aa22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CCP110O43303 1012 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 KLRC4O43908 158 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 SPAG1Q07617 926 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 STIM1Q13586 685 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PDIA5Q14554 519 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 MOB2Q70IA6 237 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf42Q96LP6 360 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ADSSL1Q8N142 457 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC15Q8TF66 581 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 FLOT1O75955 427 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEIP0CG38 1075 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 POTEJP0CG39 1038 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 AP3B2Q13367 1082 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 WNK4Q96J92 1243 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3CDO00329 1044 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM9Q9C026 710 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 C19orf81C9J6K1 198 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ICAM1P05362 532 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 STK17AQ9UEE5 414 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP6O43182 974 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX33O43247 280 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMA7O14818 248 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 COBLO75128 1261 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAF1Q13077 416 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 TC2NQ8N9U0 490 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF592Q92610 1267 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC1Q9NV70 894 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCB11O95342 1321 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 CFBP00751 764 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ASIC1P78348 528 aa22.65■■□□□ 1.22
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