RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQY0 241 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 STAM2O75886 525 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ASGR1P07306 291 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 BEX3Q00994 111 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 UBE2SQ16763 222 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 IL31RAQ8NI17 732 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 GLT1D1Q96MS3 346 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 CTAGE5O15320 804 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 PFKFB2O60825 505 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 CDKL5O76039 1030 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 CPT1AP50416 773 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 PKN1Q16512 942 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 GNPTABQ3T906 1256 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 PPFIA3O75145 1194 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ARIH2O95376 493 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 SCRN1Q12765 414 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 C6orf50Q9HD87 102 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ESYT2A0FGR8 921 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 CABYRO75952 493 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 DEXIO95424 95 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 GH1P01241 217 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 PTGS1P23219 599 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 RTP1P59025 263 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 LY6KQ17RY6 165 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 COPS5Q92905 334 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ELP1O95163 1332 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 GNA11P29992 359 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 AP3B2Q13367 1082 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 SNX17Q15036 470 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 RGS20O76081 388 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 TGFB3P10600 412 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 NLRX1Q86UT6 975 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 H0YGN5 161 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 MCTP2Q6DN12 878 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 BICD2Q8TD16 824 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 ANO3Q9BYT9 981 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 KPNA6O60684 536 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 LAMC2Q13753 1193 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 ME3Q16798 604 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM60Q495X7 471 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 A6NJR5 290 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 FIBPO43427 364 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 MYL3P08590 195 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 ICAM3P32942 547 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP1Q07960 439 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 GTF3C6Q969F1 213 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 KIF2CQ99661 725 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 STK36Q9NRP7 1315 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP5P59047 1200 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 CDHR1Q96JP9 859 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-222ENST00000532751 PGBD1Q96JS3 809 aa25.11■■□□□ 1.61
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