RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525916.1

CCDC90B-205, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC90B, Length 656 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-205ENST00000525916 NOVP48745 357 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 RBL2Q08999 1139 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 DNERQ8NFT8 737 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 KAT2BQ92831 832 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 FBXL18Q96ME1 805 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC90B-205ENST00000525916 TRIOO75962 3097 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 LY6KQ17RY6 165 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 CHST3Q7LGC8 479 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 WNT8BQ93098 351 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 DCXO43602 365 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ARHGAP1Q07960 439 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 IKBKEQ14164 716 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 MBTPS1Q14703 1052 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 34.2
CCDC90B-205ENST00000525916 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 NEK9Q8TD19 979 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ALG1Q9BT22 464 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 FSD1Q9BTV5 496 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 KAT6AQ92794 2004 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 EFCAB14O75071 495 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 GH1P01241 217 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PDHBP11177 359 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 AAMPQ13685 434 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 USH1GQ495M9 461 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ANKS1AQ92625 1134 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TOMM22Q9NS69 142 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 INSL6Q9Y581 213 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TECTAO75443 2155 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 POTEB3A0JP26 581 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 B4DLN1 442 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ORC4O43929 436 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ZNF286BP0CG31 522 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PSEN2P49810 448 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ZP2Q05996 745 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PTK7Q13308 1070 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 POTEBQ6S5H4 581 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 C7orf31Q8N865 590 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 LAMA4Q16363 1823 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 COL4A6Q14031 1691 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 LGR5O75473 907 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 ZNF543Q08ER8 600 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 MFSD10Q14728 455 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 DGKDQ16760 1214 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PTPROQ16827 1216 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 EPC2Q52LR7 807 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 VPS53Q5VIR6 699 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TBC1D5Q92609 795 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 KCNH6Q9H252 994 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 COL20A1Q9P218 1284 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PNMA2Q9UL42 364 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 AMHP03971 560 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 HIC1Q14526 733 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 BANK1Q8NDB2 785 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 CPVLQ9H3G5 476 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 DCTPP1Q9H773 170 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC90B-205ENST00000525916 HAS3O00219 553 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-205ENST00000525916 F2P00734 622 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-205ENST00000525916 FGRP09769 529 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-205ENST00000525916 GPM6BQ13491 265 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC90B-205ENST00000525916 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms