RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 KATNBL1Q9H079 304 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-218ENST00000525459 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRK-218ENST00000525459 BTBD18B2RXH4 712 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 IL31RAQ8NI17 732 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 OXER1Q8TDS5 423 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 SCFD2Q8WU76 684 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 CDHR1Q96JP9 859 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 PGBD1Q96JS3 809 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 HTTP42858 3142 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 SEPT4O43236 478 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 AKR1A1P14550 325 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 17e-7■■□□□ 12.1
PTPRK-218ENST00000525459 NR5A1Q13285 461 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 NLRX1Q86UT6 975 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TBCKQ8TEA7 893 aa21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS3O15072 1205 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 MAFGO15525 162 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 CAPN2P17655 700 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 SYT1P21579 422 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 NEK8Q86SG6 692 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 GPRASP2Q96D09 838 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.31■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TGFB3P10600 412 aa21.3■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM32Q13049 653 aa21.3■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TTLL4Q14679 1199 aa21.3■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.3■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 19e-11■□□□□ 11.3
PTPRK-218ENST00000525459 FIBPO43427 364 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 STX6O43752 255 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 CIITAP33076 1130 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF76P36508 570 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 CEP55Q53EZ4 464 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 14e-27■■■□□ 15.4
PTPRK-218ENST00000525459 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 ICAM3P32942 547 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC10P48553 1259 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 INF2Q27J81 1249 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 MCTP1Q6DN14 999 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 BRAPQ7Z569 592 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.29■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
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PTPRK-218ENST00000525459 CCL5P13501 91 aa21.28■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 CNGA1P29973 690 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRK-218ENST00000525459 MTMR1Q13613 665 aa21.28■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 JADE2Q9NQC1 790 aa21.28■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.28■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 TRPV1Q8NER1 839 aa21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.27■■□□□ 1
PTPRK-218ENST00000525459 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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PTPRK-218ENST00000525459 RGS20O76081 388 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 RARBP10826 455 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 CYP3A7P24462 503 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 TNFAIP2Q03169 654 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 RNF208Q9H0X6 261 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 Q9Y3F1 56 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 MEIS1O00470 390 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 ITGB5P18084 799 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 KIF28PB7ZC32 967 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRK-218ENST00000525459 LETM2Q2VYF4 491 aa21.25■□□□□ 0.99
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