RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TTC14	Q96N46	770 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM50B	Q9Y247	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MYH7	P12883	1935 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	NCK2	O43639	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	DGKD	Q16760	1214 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TCTN1	Q2MV58	587 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TRANK1	O15050	2925 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263		H3BNC9	293 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	LGR5	O75473	907 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	F2	P00734	622 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PDHB	P11177	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	STXBP2	Q15833	593 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SCN5A	Q14524	2016 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	LCT	P09848	1927 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	AMH	P03971	560 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PSEN2	P49810	448 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	NT5C2	P49902	561 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ZP2	Q05996	745 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	BANK1	Q8NDB2	785 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MFSD10	Q14728	455 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63	7e-7	■■■■□ 22.4
VIRMA-208	ENST00000523263	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	PPTC7	Q8NI37	304 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	UIMC1	Q96RL1	719 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	REV3L	O60673	3130 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ABCB11	O95342	1321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VIRMA-208	ENST00000523263	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	TET1	Q8NFU7	2136 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	CAND2	O75155	1236 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	RSPH10B	P0C881	870 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	HOXC8	P31273	242 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	GPM6B	Q13491	265 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	SERINC5	Q86VE9	423 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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