RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 CPA1P15085 419 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMARCA1P28370 1054 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRAF1Q13077 416 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 MFSD5Q6N075 450 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 FANCBQ8NB91 859 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.51■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SORBS3O60504 671 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 GH1P01241 217 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 CSF2RAP15509 400 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 GNAQP50148 359 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 APOA5Q6Q788 366 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 VSIG10LQ86VR7 867 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 DEFB123Q8N688 67 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 MMP3P08254 477 aa28.49■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.49■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.49■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.49■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.49■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 GPR153Q6NV75 609 aa28.48■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNB2Q92953 911 aa28.48■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 HIPK3Q9H422 1215 aa28.48■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCN5AQ14524 2016 aa28.47■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 ACRP10323 421 aa28.47■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHMP4BP1P59074 171 aa28.47■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 MEIS2O14770 477 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 CYP2C9P11712 490 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCND2P30279 289 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 HSPA4P34932 840 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SP2Q02086 613 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.46■■■□□ 2.15
LAPTM4B-202ENST00000517924 KPNA6O60684 536 aa28.45■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCL23P55773 120 aa28.45■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 KRT32Q14532 448 aa28.45■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 KAT2BQ92831 832 aa28.45■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.45■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.45■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.44■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM240Q5SV17 173 aa28.44■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.44■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM199Q8N511 208 aa28.44■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.44■■■□□ 2.14
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LAPTM4B-202ENST00000517924 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.43■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.43■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.43■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 COL6A3P12111 3177 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 PIK3CDO00329 1044 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBTB43O43298 467 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 GGPS1O95749 300 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 FUT2Q10981 343 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 UBE2SQ16763 222 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 RTN1Q16799 776 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM161BQ96MY7 647 aa28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF286BP0CG31 522 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 SEMA3FQ13275 785 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 LAMC2Q13753 1193 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 DGKDQ16760 1214 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF365Q70YC5 407 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPTC7Q8NI37 304 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 CUL5Q93034 780 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCLYQ96I15 445 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.41■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDC27P30260 824 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 APOBRQ0VD83 1088 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 VWCEQ96DN2 955 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 IL23AQ9NPF7 189 aa28.4■■■□□ 2.14
LAPTM4B-202ENST00000517924 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
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