RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516552.1

RNU6-118P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 118, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-118P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-118P-201ENST00000516552 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 FASLGP48023 281 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 TNFRSF9Q07011 255 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 CD300CQ08708 224 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 FUT7Q11130 342 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXI1Q12951 378 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXL1Q12952 345 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 SQSTM1Q13501 440 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 BFSP2Q13515 415 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ARID5BQ14865 1188 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 AP5B1Q2VPB7 878 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF792Q3KQV3 632 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 NBPF14Q5TI25 921 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM46CQ5VWP2 391 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 LINC00336Q6ZUF6 198 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 BRINP3Q76B58 766 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 CUZD1Q86UP6 607 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ULK2Q8IYT8 1036 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 RIN3Q8TB24 985 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 BICD2Q8TD16 824 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 NETO1Q8TDF5 533 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ASAP3Q8TDY4 903 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 EPS8L1Q8TE68 723 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 SLC25A28Q96A46 364 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 WNK4Q96J92 1243 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 LOXL4Q96JB6 756 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 HHIPL1Q96JK4 782 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 MARK4Q96L34 752 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 KREMEN1Q96MU8 473 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXN4Q96NZ1 517 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 CDK15Q96Q40 435 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF347Q96SE7 839 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 IL21Q9HBE4 155 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 GJB4Q9NTQ9 266 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 USP20Q9Y2K6 914 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 U3KQA8 63 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 CR1P17927 2039 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-118P-201ENST00000516552 GRIN2DO15399 1336 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 RNF123Q5XPI4 1314 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 DISP3Q9P2K9 1392 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM221AA4D161 298 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 PMS2P1A4D2B8 440 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 GRID2IPA4D2P6 1211 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 LRCOL1A6NCL2 159 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 C2orf72A6NCS6 295 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 ESPNB1AK53 854 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 ERVV-1B6SEH8 477 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 USP17L10C9JJH3 530 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 MAN1A2O60476 641 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 RAMP2O60895 175 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 LILRB5O75023 590 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 CILPO75339 1184 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 AGFG2O95081 481 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 TBC1D8O95759 1140 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 GCP02774 474 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 IGKV3-11P04433 115 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 ITGB1P05556 798 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 KRT16P08779 473 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 GM2AP17900 193 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 PSMD8P48556 350 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 CDK8P49336 464 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 PSEN2P49810 448 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 BCAMP50895 628 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 CCT4P50991 539 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 EPHB3P54753 998 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 DSCR10P59022 87 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 CYP27A1Q02318 531 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 RUNX1T1Q06455 604 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 MGAT3Q09327 533 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 DBN1Q16643 649 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 MIIPQ5JXC2 388 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-118P-201ENST00000516552 CEP85LQ5SZL2 805 aa-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms