RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-222ENST00000514552 GUCY2CP25092 1073 aa9.04□□□□□ -0.96
PDE4D-222ENST00000514552 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-222ENST00000514552 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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PDE4D-222ENST00000514552 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-222ENST00000514552 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-222ENST00000514552 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-222ENST00000514552 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-222ENST00000514552 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-222ENST00000514552 VAV3Q9UKW4 847 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-222ENST00000514552 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.98□□□□□ -0.97
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