RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 FAAP100Q0VG06 881 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2SQ16763 222 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GBF1Q92538 1859 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SORBS3O60504 671 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MYL3P08590 195 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK7P50613 346 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAF1Q13077 416 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ARVCFO00192 962 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PPFIA3O75145 1194 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 BMP8BP34820 402 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 RUFY3Q7L099 469 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 BADQ92934 168 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3CDO00329 1044 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP3P08254 477 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMA5P28066 241 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CCND2P30279 289 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CPT1AP50416 773 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 RCAN1P53805 252 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 AFG1LQ8WV93 481 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TBX21Q9UL17 535 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 A6NJR5 290 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 STXBP3O00186 592 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ZEB2O60315 1214 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA7Q13683 1181 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL16Q8N461 479 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TOX2Q96NM4 488 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR81Q562E7 1941 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0355O15063 1070 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 GH1P01241 217 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SP2Q02086 613 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA3FQ13275 785 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CUL5Q93034 780 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PGBD1Q96JS3 809 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 B4GALT4O60513 344 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CABYRO75952 493 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC24BO95487 1268 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 CD4P01730 458 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 NAPAP54920 295 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 TDHQ8IZJ6 230 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 PHKBQ93100 1093 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-218ENST00000511185 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.52■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPC1 479 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS3O15072 1205 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC34A2O95436 690 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF286BP0CG31 522 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 EPHB4P54760 987 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 LRCH3Q96II8 777 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 GGPS1O95749 300 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 EVCP57679 992 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 NTRK3Q16288 839 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRSQ13332 1948 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-218ENST00000511185 SIP14410 1827 aa21.5■■□□□ 1.03
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