RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 MIER1Q8N108 512 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 ALG1Q9BT22 464 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 DGKHQ86XP1 1220 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-215ENST00000510074 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-215ENST00000510074 ESR2Q92731 530 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-215ENST00000510074 YME1L1Q96TA2 773 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-215ENST00000510074 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-215ENST00000510074 VAT1LQ9HCJ6 419 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-215ENST00000510074 COL20A1Q9P218 1284 aa18.53■□□□□ 0.56
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