RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 RASGRF1Q13972 1273 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 OSBP2Q969R2 916 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 RNF38Q9H0F5 515 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.21□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 BLACEA4D250 179 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SGSM2O43147 1006 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 MSCO60682 206 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB7AO95365 584 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 NCAM1P13591 858 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 LSAMPQ13449 338 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 RASA3Q14644 834 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SLC9A5Q14940 896 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 MROH9Q5TGP6 573 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 NSMFQ6X4W1 530 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PWWP2AQ96N64 755 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CLDND1Q9NY35 253 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 X6R8D5 127 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 FOXO4P98177 505 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 RBL2Q08999 1139 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 NTRK3Q16288 839 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 VMACQ2NL98 169 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SEC14L1Q92503 715 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 GPR27Q9NS67 375 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 H7BY64 318 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 ADCY3O60266 1144 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A11P48066 632 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SNTG2Q9NY99 539 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PALD1Q9ULE6 856 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 FBLN7Q53RD9 439 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 DCAF4Q8WV16 495 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 BMP7P18075 431 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 STEAP3Q658P3 488 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CDC6Q99741 560 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 SYT3Q9BQG1 590 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 JAM3Q9BX67 310 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CDIP1Q9H305 208 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-215ENST00000506510 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM13O60858 407 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 DGKIO75912 1065 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 C8BP07358 591 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 FAM153BP0C7A2 387 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 FAM209AQ5JX71 171 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 STYK1Q6J9G0 422 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 LBX2Q6XYB7 198 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ASXL2Q76L83 1435 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 MIB1Q86YT6 1006 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 DDX11Q96FC9 970 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 NOX5Q96PH1 765 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 FFAR3O14843 346 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 INHBBP09529 407 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 CYP2C8P10632 490 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-215ENST00000506510 GRK2P25098 689 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms