RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 RASEFQ8IZ41 740 aa22.43■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 AFG1LQ8WV93 481 aa22.43■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.43■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 HIPK3Q9H422 1215 aa22.43■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.43■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 CSF2RAP15509 400 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 CYP2C18P33260 490 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 FANCBQ8NB91 859 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 IL31RAQ8NI17 732 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 KCNB2Q92953 911 aa22.42■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 TGFB3P10600 412 aa22.41■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 TMEM240Q5SV17 173 aa22.41■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 RASIP1Q5U651 963 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 RXRAP19793 462 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 CCND2P30279 289 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 LAMC2Q13753 1193 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 KRT32Q14532 448 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 IL23AQ9NPF7 189 aa22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP40-217ENST00000496298 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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USP40-217ENST00000496298 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.39■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 KAT2BQ92831 832 aa22.39■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.39■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 COL6A3P12111 3177 aa22.39■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 MEIS2O14770 477 aa22.38■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 STAM2O75886 525 aa22.38■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 DGKDQ16760 1214 aa22.38■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.38■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 PPTC7Q8NI37 304 aa22.38■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 CYP2C9P11712 490 aa22.36■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 SP2Q02086 613 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 MICU3Q86XE3 530 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 HERVK_113Q902F9 699 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 CUL5Q93034 780 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 VWCEQ96DN2 955 aa22.36■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.36■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 HSPA4P34932 840 aa22.35■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 CCL23P55773 120 aa22.35■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.35■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.35■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.35■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 GUCD1Q96NT3 240 aa22.35■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.35■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 PITPNM1O00562 1244 aa22.34■■□□□ 1.17
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USP40-217ENST00000496298 F2P00734 622 aa22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 FGBP02675 491 aa22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 RCAN1P53805 252 aa22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.34■■□□□ 1.17
USP40-217ENST00000496298 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.34■■□□□ 1.17
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