RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.05■■□□□ 1.92
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SIMC1-208ENST00000495423 AFG1LQ8WV93 481 aa27.05■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 FAM227BQ96M60 508 aa27.05■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 EPHX3Q9H6B9 360 aa27.05■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 GH1P01241 217 aa27.04■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 CXCL10P02778 98 aa27.04■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 SELPP16109 830 aa27.04■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP1Q07960 439 aa27.04■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 KAT2BQ92831 832 aa27.04■■□□□ 1.92
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SIMC1-208ENST00000495423 PDE4AP27815 886 aa27.03■■□□□ 1.92
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SIMC1-208ENST00000495423 CNKSR3Q6P9H4 555 aa27.03■■□□□ 1.92
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SIMC1-208ENST00000495423 PIEZO1Q92508 2521 aa27.03■■□□□ 1.92
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SIMC1-208ENST00000495423 CHMP4BP1P59074 171 aa27.02■■□□□ 1.92
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SIMC1-208ENST00000495423 MFSD6Q6ZSS7 791 aa27.02■■□□□ 1.92
SIMC1-208ENST00000495423 MUC6Q6W4X9 2439 aa27.01■■□□□ 1.92
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SIMC1-208ENST00000495423 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
SIMC1-208ENST00000495423 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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SIMC1-208ENST00000495423 NBNO60934 754 aa27■■□□□ 1.91
SIMC1-208ENST00000495423 GOLGA8HP0CJ92 632 aa27■■□□□ 1.91
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SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D5Q92609 795 aa27■■□□□ 1.91
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SIMC1-208ENST00000495423 ZBED2Q9BTP6 218 aa27■■□□□ 1.91
SIMC1-208ENST00000495423 COL20A1Q9P218 1284 aa27■■□□□ 1.91
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SIMC1-208ENST00000495423 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.99■■□□□ 1.91
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SIMC1-208ENST00000495423 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.94■■□□□ 1.9
SIMC1-208ENST00000495423 PPTC7Q8NI37 304 aa26.94■■□□□ 1.9
SIMC1-208ENST00000495423 ANKS1AQ92625 1134 aa26.94■■□□□ 1.9
SIMC1-208ENST00000495423 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SIMC1-208ENST00000495423 MFSD10Q14728 455 aa26.93■■□□□ 1.9
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.93■■□□□ 1.9
SIMC1-208ENST00000495423 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.93■■□□□ 1.9
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