RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM199Q8N511 208 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 NEK1Q96PY6 1258 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTPRU-207ENST00000492954 CALM2P0DP24 149 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 CALM3P0DP25 149 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.83■□□□□ 0.93
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PTPRU-207ENST00000492954 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-207ENST00000492954 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.83■□□□□ 0.93
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PTPRU-207ENST00000492954 CCL23P55773 120 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 CHMP4BP1P59074 171 aa20.82■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 SORBS3O60504 671 aa20.8■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.8■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.79■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.78■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 SCLYQ96I15 445 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 CDH23Q9H251 3354 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 GGPS1O95749 300 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF286BP0CG31 522 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
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PTPRU-207ENST00000492954 GUCD1Q96NT3 240 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRU-207ENST00000492954 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.77■□□□□ 0.91
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PTPRU-207ENST00000492954 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 PIK3CDO00329 1044 aa20.76■□□□□ 0.91
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PTPRU-207ENST00000492954 SPATA33Q96N06 139 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB43O43298 467 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 F2P00734 622 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 FGBP02675 491 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 HSPA4P34932 840 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 PSEN2P49810 448 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 PTGISQ16647 500 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRU-207ENST00000492954 RTN1Q16799 776 aa20.75■□□□□ 0.91
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