RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	HIPK3	Q9H422	1215 aa		19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		19.96	■□□□□ 0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	ARIH2	O95376	493 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PFKM	P08237	780 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP1	Q07960	439 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PGM5	Q15124	567 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	IL23A	Q9NPF7	189 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		19.95	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	B4GALT4	O60513	344 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PPFIA4	O75335	1185 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL3	P08590	195 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CCND2	P30279	289 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHB4	P54760	987 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	DGKD	Q16760	1214 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM240	Q5SV17	173 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCB	Q8NB91	859 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PPTC7	Q8NI37	304 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNB2	Q92953	911 aa		19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PITPNM1	O00562	1244 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMA5	P28066	241 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	ICAM3	P32942	547 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA4	P34932	840 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6K	Q17RY6	165 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CUL5	Q93034	780 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS20	O76081	388 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP3	P08254	477 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CSF2RA	P15509	400 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	RFC2	P35250	354 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMC6	P62333	389 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL16	Q8N461	479 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	AFG1L	Q8WV93	481 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	HERVK_113	Q902F9	699 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	COPS5	Q92905	334 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	19.92	■□□□□ 0.78	1e-6	■■■□□ 17.6
HDAC10-216	ENST00000489424	USP26	Q9BXU7	913 aa		19.92	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	FGB	P02675	491 aa		19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGS1	P23219	599 aa		19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	FGD1	P98174	961 aa		19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	19.91	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2C18	P33260	490 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	RBL2	Q08999	1139 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	BFSP2	Q13515	415 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CAGE1	Q8TC20	777 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		19.9	■□□□□ 0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	HAS3	O00219	553 aa		19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIS2	O14770	477 aa		19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	NEDD9	Q14511	834 aa		19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	APOA5	Q6Q788	366 aa		19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT2B	Q92831	832 aa		19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		19.89	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	MAFG	O15525	162 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	F2	P00734	622 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF365	Q70YC5	407 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	RASEF	Q8IZ41	740 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	RETREG2	Q8NC44	543 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	CDHR1	Q96JP9	859 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM161B	Q96MY7	647 aa		19.88	■□□□□ 0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77

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