RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 DPF3Q92784 378 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PTPN18Q99952 460 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 CROTQ9UKG9 612 aa5.25□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 KCNH1O95259 989 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 FPR2P25090 351 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 SLC7A5Q01650 507 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 SURF1Q15526 300 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 ZNF394Q53GI3 561 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PRR31Q5SQ13 230 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 ERICH6Q7L0X2 663 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PLEKHH3Q7Z736 793 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 MIB1Q86YT6 1006 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 CRBNQ96SW2 442 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 CD248Q9HCU0 757 aa5.24□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 SCRN1Q12765 414 aa5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 ADAM9Q13443 819 aa5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 AKT3Q9Y243 479 aa5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.23□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 B4GALT4O60513 344 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 ZNF28P17035 718 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 IL13P35225 146 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 NKX3-2P78367 333 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 PPP2R5EQ16537 467 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 INF2Q27J81 1249 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 KBTBD2Q8IY47 623 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 SEC14L1Q92503 715 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.22□□□□□ -1.57
SENP6-210ENST00000487548 C9orf118A6NHY6 69 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 MUSKO15146 869 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 ZNF76P36508 570 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 SELENOPP49908 381 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 PPP2CBP62714 309 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 PPP2CAP67775 309 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 GRB10Q13322 594 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 CCDC27Q2M243 656 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 CR1LQ2VPA4 569 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.21□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 CEP68Q76N32 757 aa5.2□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 MBD6Q96DN6 1003 aa5.2□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 CLIC6Q96NY7 704 aa5.2□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 LGR4Q9BXB1 951 aa5.2□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 BCL11AQ9H165 835 aa5.2□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 A0A1W2PQH9 124 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 ZNF623O75123 536 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 FHL2Q14192 279 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 PHF19Q5T6S3 580 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 DNERQ8NFT8 737 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 GINM1Q9NU53 330 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.19□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 ERCC3P19447 782 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 GNRHR2Q96P88 292 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 MMP19Q99542 508 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.18□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 BCL6P41182 706 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 SLC6A11P48066 632 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 EPHB4P54760 987 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 COPS5Q92905 334 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 RBPJLQ9UBG7 517 aa5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 PATE3B3GLJ2 98 aa5.16□□□□□ -1.58
SENP6-210ENST00000487548 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms