RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, human

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHQ1-208	ENST00000482785	MYOG	P15173	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	PHKA2	P46019	1235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785		A0A1B0GTH6	734 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PDPK1	O15530	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SPINT1	O43278	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FBXO24	O75426	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	HMGCR	P04035	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	BMP2	P12643	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SDHB	P21912	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PML	P29590	882 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SHC2	P98077	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZXDA	P98168	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FPGS	Q05932	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785		A0A1W2PNR3	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ECE2	O60344	883 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	UPP2	O95045	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PRB1	P04280	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	BCR	P11274	1271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CRK	P46108	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	GIPR	P48546	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RABGGTB	P53611	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	GYS2	P54840	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	AMPD3	Q01432	767 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	POU4F2	Q12837	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	DDR2	Q16832	855 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	TCF12	Q99081	682 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	FEZ1	Q99689	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF536	O15090	1300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PSME4	Q14997	1843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	NF1	P21359	2839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	WNT10B	O00744	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHQ1-208	ENST00000482785	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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