RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 NYAP2Q9P242 653 aa7□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHA6Q9UN73 950 aa7□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHA4Q9UN74 947 aa7□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1W2PQ27 194 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1W2PQ64 194 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1W2PQD8 194 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 CARNS1A5YM72 827 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 SMCO2A6NFE2 343 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM75PA6NK02 468 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 F5H6K3 240 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 M0R2N6 131 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 CUTAO60888 179 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PPP6R2O75170 966 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 NDUFB10O96000 172 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 CMA1P23946 247 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 EPS15P42566 896 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TYRO3Q06418 890 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 KLRC3Q07444 240 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 VAC14Q08AM6 782 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 IL17AQ16552 155 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 MAP3K11Q16584 847 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ASPRV1Q53RT3 343 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TTC38Q5R3I4 469 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 RESP18Q5W5W9 173 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 DLK2Q6UY11 383 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TEPSINQ96N21 525 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 HACL1Q9UJ83 578 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 FZD1Q9UP38 647 aa6.99□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 FOXN1O15353 648 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 MYO1BO43795 1136 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 KINO60870 393 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF202O95125 648 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 CALML3P27482 149 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 SMARCA1P28370 1054 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 MCM7P33993 719 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 SLC1A4P43007 532 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 NR1H3Q13133 447 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 DGKZQ13574 1117 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 UBE2SQ16763 222 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 INF2Q27J81 1249 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF787Q6DD87 383 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 FAM83AQ86UY5 434 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 DCAF4Q8WV16 495 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 DPF2Q92785 391 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 SYT17Q9BSW7 474 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 CSRNP2Q9H175 543 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 HPSEQ9Y251 543 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.98□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 A0A087X0B3 334 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM232C9JQI7 657 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 BIN1O00499 593 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 EDIL3O43854 480 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 LMNB1P20700 586 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 TNNI2P48788 182 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 RAB15P59190 212 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 LONRF3Q496Y0 759 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 ISM2Q6H9L7 571 aa6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SKAP2-204ENST00000481204 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms