RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 FAM47CQ5HY64 1035 aa17.58■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SESTD1Q86VW0 696 aa17.58■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 KLRF2D3W0D1 207 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 RFXAPO00287 272 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 HIP1O00291 1037 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SP2Q02086 613 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 RBL2Q08999 1139 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CCDC178Q5BJE1 867 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 KRT23Q9C075 422 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 RAD50Q92878 1312 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 F2P00734 622 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 GH1P01241 217 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CA3P07451 260 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 NR3C2P08235 984 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 ZNF286BP0CG31 522 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 TROAPQ12815 778 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MBTPS1Q14703 1052 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 GRM4Q14833 912 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 IWS1Q96ST2 819 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MSRAQ9UJ68 235 aa17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 ZBBXA8MT70 800 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 ZBTB5O15062 677 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 KPNA6O60684 536 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 NBNO60934 754 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CFBP00751 764 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PFKMP08237 780 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 STXBP2Q15833 593 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 KRT40Q6A162 431 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CHST3Q7LGC8 479 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PPM1EQ8WY54 764 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PIGSQ96S52 555 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 AMNQ9BXJ7 453 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CNNM2Q9H8M5 875 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CTNNA3Q9UI47 895 aa17.55■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SIP14410 1827 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 LCHNA4D1U4 455 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SGSM2O43147 1006 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SEMA3FQ13275 785 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PGM5Q15124 567 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PTGISQ16647 500 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PPP2R2DQ66LE6 453 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MCF2L2Q86YR7 1114 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.54■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 E7EWF7 191 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 SORBS3O60504 671 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CXCL10P02778 98 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 RFC2P35250 354 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PSEN2P49810 448 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 DEFB103AP81534 67 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 TAP1Q03518 808 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 TJAP1Q5JTD0 557 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MYSM1Q5VVJ2 828 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 BDP1A6H8Y1 2624 aa17.53■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 LPXNO60711 386 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 HOXC8P31273 242 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 HOMER1Q86YM7 354 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 HERC6Q8IVU3 1022 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 PPTC7Q8NI37 304 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 C16orf70Q9BSU1 422 aa17.52■□□□□ 0.4
TNS1-216ENST00000480665 CERS4Q9HA82 394 aa17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms