RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TRIM60Q495X7 471 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ELP1O95163 1332 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 NAPAP54920 295 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 UBE2SQ16763 222 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PHKBQ93100 1093 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.09■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 ZEB2O60315 1214 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 PPFIA3O75145 1194 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 SCG2P13521 617 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-211ENST00000480301 SYN1P17600 705 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 STK3Q13188 491 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SMCO2A6NFE2 343 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 A6NJR5 290 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 CABYRO75952 493 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 GH1P01241 217 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 AK2P54819 239 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 TLE2Q04725 743 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP1Q07960 439 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 STAM2O75886 525 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 CPT1AP50416 773 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 CDK7P50613 346 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ADCY7P51828 1080 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SP2Q02086 613 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SCRN1Q12765 414 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD1Q15327 319 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 TOX2Q96NM4 488 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ARVCFO00192 962 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 CPLX1O14810 134 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PFKFB2O60825 505 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 MYL3P08590 195 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 TGFB3P10600 412 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ICAM3P32942 547 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 NEK4P51957 841 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 AFG1LQ8WV93 481 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 GLT8D2Q9H1C3 349 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 GRIN2DO15399 1336 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ESYT2A0FGR8 921 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PSMC6P62333 389 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SEMA3FQ13275 785 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 GNPTABQ3T906 1256 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PRO3102Q9H379 93 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS3O15072 1205 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 MMP3P08254 477 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 ITGA7Q13683 1181 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 LAMC2Q13753 1193 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 PGBD1Q96JS3 809 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 TMEM260Q9NX78 707 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 TRIM43BA6NCK2 446 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-211ENST00000480301 KPNA6O60684 536 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms