RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478188.5

POLR2B-208, Transcript of RNA polymerase II subunit B, human

TSL 2

Gene POLR2B, Length 3,093 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR2B-208	ENST00000478188	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ABCB11	O95342	1321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188		H0YGN5	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PRC1	O43663	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	MSC	O60682	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ALAS1	P13196	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CDK7	P50613	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	GDF15	Q99988	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	RAD21	O60216	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ARIH2	O95376	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	AKR1A1	P14550	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SMPD1	P17405	629 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	WTAP	Q15007	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ZBTB5	O15062	677 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	RCAN1	P53805	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PIGS	Q96S52	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188		A0A1W2PQY0	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TRIM66	O15016	1216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CPA1	P15085	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ITGB8	P26012	769 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	CDC27	P30260	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	MCM5	P33992	734 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	BMP8B	P34820	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	NTRK3	Q16288	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188		Q9Y3F1	56 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
POLR2B-208	ENST00000478188	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms