RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 OPLAHO14841 1288 aa22.95■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 PIGSQ96S52 555 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-210ENST00000472880 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-210ENST00000472880 IGFBP4P22692 258 aa22.91■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-210ENST00000472880 PPTC7Q8NI37 304 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-210ENST00000472880 SLC9A7Q96T83 725 aa22.91■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 SENP2Q9HC62 589 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-210ENST00000472880 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-210ENST00000472880 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.9■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.9■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.9■■□□□ 1.26
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COL9A3-210ENST00000472880 CYTH3O43739 400 aa22.88■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 MFSD10Q14728 455 aa22.88■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 BAIAP3O94812 1187 aa22.87■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 ANTXR2P58335 489 aa22.87■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.87■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.87■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 SELPP16109 830 aa22.86■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
COL9A3-210ENST00000472880 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.86■■□□□ 1.25
COL9A3-210ENST00000472880 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.85■■□□□ 1.25
COL9A3-210ENST00000472880 HAS3O00219 553 aa22.85■■□□□ 1.25
COL9A3-210ENST00000472880 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
COL9A3-210ENST00000472880 TGFB3P10600 412 aa22.85■■□□□ 1.25
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