RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 GGA2Q9UJY4 613 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 RASSF9O75901 435 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 IL2RBP14784 551 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SMTNP53814 917 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 PLCB4Q15147 1175 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP57Q86XR8 500 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 TMOD1P28289 359 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 EHHADHQ08426 723 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DYMQ7RTS9 669 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CD302Q8IX05 232 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CPVLQ9H3G5 476 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 MCM8Q9UJA3 840 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 BCORQ6W2J9 1755 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 FLT1P17948 1338 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 RAD51CO43502 376 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SCP2P22307 547 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 QPCTQ16769 361 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF384Q8TF68 577 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 BTG4Q9NY30 223 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DOCK2Q92608 1830 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPY2A6NKD2 308 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRNDQ07001 517 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 LETM2Q2VYF4 491 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 FIGNQ5HY92 759 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SUSD4Q5VX71 490 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 BAP1Q92560 729 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC114Q96M63 670 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CLGNO14967 610 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM107AO95990 144 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CALML3P27482 149 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 TECP42680 631 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC41Q15345 812 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SCLT1Q96NL6 688 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 LCA5LO95447 670 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 KLRC1P26715 233 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 NEDD9Q14511 834 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 WLSQ5T9L3 541 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 MREGQ8N565 214 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 JAG2Q9Y219 1238 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 E2F5Q15329 346 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 MYH3P11055 1940 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DNM1LO00429 736 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 OPLAHO14841 1288 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DRP2Q13474 957 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 HGSNATQ68CP4 663 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 PDXDC1Q6P996 788 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 BANK1Q8NDB2 785 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM170AA1A519 330 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 ERVK-9P63128 1117 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms