RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	IL31RA	Q8NI17	732 aa		20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	20.38	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	SCRN1	Q12765	414 aa		20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PRO3102	Q9H379	93 aa		20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		20.37	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PFKFB2	O60825	505 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CDKL5	O76039	1030 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ACLY	P53396	1101 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PKN1	Q16512	942 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	NECAB1	Q8N987	351 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	COPS5	Q92905	334 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PHF24	Q9UPV7	400 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902		Q9Y3F1	56 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		20.36	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ZEB2	O60315	1214 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ARIH2	O95376	493 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	LY6K	Q17RY6	165 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	C6orf50	Q9HD87	102 aa		20.35	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQY0	241 aa		20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ASGR1	P07306	291 aa		20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ME3	Q16798	604 aa		20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		20.34	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	DTNB	O60941	627 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	DEXI	O95424	95 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	LARGE1	O95461	756 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CPT1A	P50416	773 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	PGBD1	Q96JS3	809 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	KIF2C	Q99661	725 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	TMEM260	Q9NX78	707 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		20.33	■□□□□ 0.85
USP19-210	ENST00000465902	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		20.33	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CTAGE5	O15320	804 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	SORBS3	O60504	671 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	STAM2	O75886	525 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	GH1	P01241	217 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	GNA11	P29992	359 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	NLRP5	P59047	1200 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		20.32	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ESYT2	A0FGR8	921 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	RGS20	O76081	388 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	MYL3	P08590	195 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	RTP1	P59025	263 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	RABEP1	Q15276	862 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	BICD2	Q8TD16	824 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	GTF3C6	Q969F1	213 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ANO3	Q9BYT9	981 aa		20.31	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	NKX3-2	P78367	333 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	AP3B2	Q13367	1082 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	TRIM60	Q495X7	471 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	NLRX1	Q86UT6	975 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	AFG1L	Q8WV93	481 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	AIFM3	Q96NN9	605 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		20.3	■□□□□ 0.84
USP19-210	ENST00000465902	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84

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