RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 TTC38Q5R3I4 469 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 ARMCX2Q7L311 632 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 EDNRBP24530 442 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 STXBP2Q15833 593 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM17Q9Y577 477 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 WNT7AO00755 349 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 TDP2O95551 362 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CCL14Q16627 93 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 TINF2Q9BSI4 451 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 EDIL3O43854 480 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 MCM7P33993 719 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 RAET1EQ8TD07 263 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 FAM86B1E9PN63 330 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CIITAP33076 1130 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF174Q15697 407 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CEP55Q53EZ4 464 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 TNS4Q8IZW8 715 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 MORC4Q8TE76 937 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 STAM2O75886 525 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 PRMT2P55345 433 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 IRF5Q13568 498 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 PRR16Q569H4 304 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
HOXA4-202ENST00000428284 ITGB5P18084 799 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 TRIB2Q92519 343 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 USP28Q96RU2 1077 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 SLC37A4O43826 429 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 NEMFO60524 1076 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CYP3A7P24462 503 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 GNPTABQ3T906 1256 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 ANO1Q5XXA6 986 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 NLRX1Q86UT6 975 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CYP2C19P33261 490 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 KRT85P78386 507 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 MTMR1Q13613 665 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 POTEDQ86YR6 584 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 MBOAT7Q96N66 472 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 JADE2Q9NQC1 790 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CLIC4Q9Y696 253 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 MEIS1O00470 390 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 ADCY3O60266 1144 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 RGS20O76081 388 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 ELNP15502 786 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 Q4G0T1 1027 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 ATL3Q6DD88 541 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 LENG9Q96B70 501 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 VTA1Q9NP79 307 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP45Q9UL16 551 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 GPRASP2Q96D09 838 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA4-202ENST00000428284 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.35■■□□□ 1.33
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