RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 USP40Q9NVE5 1235 aa11.98□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.98□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0232Q92628 1395 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 H7C0C1 242 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 SAT1P21673 171 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5OP48047 213 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH3Q86UC2 560 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD35Q8N283 1001 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 RETREG2Q8NC44 543 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 MMS19Q96T76 1030 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC4O95801 387 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2IP78347 998 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ESYT2A0FGR8 921 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ALAS1P13196 640 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 LMNB1P20700 586 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4A11Q02928 519 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL13Q8N6R0 699 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 HDAC11Q96DB2 347 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 CUEDC2Q9H467 287 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC4O15439 1325 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 IKBKBO14920 756 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ODR4Q5SWX8 454 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 KAZNQ674X7 775 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO11Q86XK2 927 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC43Q8N309 656 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 SPDL1Q96EA4 605 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO3Q9BYT9 981 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 EPB41L5Q9HCM4 733 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YIN7 160 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKG1Q13976 671 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NME8Q8N427 588 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NT5C1BQ96P26 610 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CLIC4Q9Y696 253 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS12O14924 1447 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RCN2Q14257 317 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 E2F5Q15329 346 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR2MP0CAP2 368 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC10P48553 1259 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 CXorf38Q8TB03 319 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM4Q9C037 500 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF14Q9UBS8 474 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 NR2F2P24468 414 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PLTPP55058 493 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MCUQ8NE86 351 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP4K1Q92918 833 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 LRGUKQ96M69 825 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 THEGQ9P2T0 379 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 DDAH1O94760 285 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-202ENST00000426333 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms