RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 FOXO4P98177 505 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 LSAMPQ13449 338 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 X6R8D5 127 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 MYO15BQ96JP2 1530 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-210ENST00000425184 DLX3O60479 287 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 FGFR1P11362 822 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 LCP1P13796 627 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 BMP7P18075 431 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MC3RP41968 323 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 NLRP10Q86W26 655 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ARMC5Q96C12 935 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 H7BY64 318 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PDPK1O15530 556 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PRODHO43272 600 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 INHBBP09529 407 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CAP1Q01518 475 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CHRNA2Q15822 529 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 NSMFQ6X4W1 530 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 USP53Q70EK8 1073 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 GPR27Q9NS67 375 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CLDND1Q9NY35 253 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SGSM2O43147 1006 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 TRIM13O60858 407 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 RASGRF1Q13972 1273 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 VMACQ2NL98 169 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MTERF2Q49AM1 385 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 OSBP2Q969R2 916 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SPATA9Q9BWV2 254 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CCDC113Q9H0I3 377 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PALD1Q9ULE6 856 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 DGKIO75912 1065 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SASH1O94885 1247 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CYP2C8P10632 490 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SPATC1Q76KD6 591 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SP8Q8IXZ3 490 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 DCAF4Q8WV16 495 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 KCNC2Q96PR1 638 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.93□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 FFAR3O14843 346 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 HTRA3P83110 453 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 STEAP3Q658P3 488 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 DPH6Q7L8W6 267 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MIB1Q86YT6 1006 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 DDX11Q96FC9 970 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.92□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 C8BP07358 591 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 RBL2Q08999 1139 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 NTRK3Q16288 839 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SOGA3Q5TF21 947 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SH3D21A4FU49 640 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 KRIT1O00522 736 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 ADCY3O60266 1144 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MAFKO60675 156 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 MSCO60682 206 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 HOXA5P20719 270 aa5.9□□□□□ -1.46
RBM39-210ENST00000425184 SERINC3Q13530 473 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms