RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	RASEF	Q8IZ41	740 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	AFG1L	Q8WV93	481 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	HIPK3	Q9H422	1215 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	RGS20	O76081	388 aa		34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	IL31RA	Q8NI17	732 aa		34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		34.34	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		34.33	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	34.33	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	34.33	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	34.33	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	34.33	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		34.32	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	MMP3	P08254	477 aa		34.32	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	34.32	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	FANCB	Q8NB91	859 aa		34.32	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	34.32	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	CCND2	P30279	289 aa		34.31	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	34.31	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		34.31	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		34.31	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	34.31	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		34.3	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		34.3	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM240	Q5SV17	173 aa		34.3	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	34.3	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		34.3	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	LAMC2	Q13753	1193 aa		34.29	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		34.29	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	34.29	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		34.29	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		34.29	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	ACR	P10323	421 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	KRT32	Q14532	448 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	MICU3	Q86XE3	530 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	IL23A	Q9NPF7	189 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	CYP2C9	P11712	490 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	CCL23	P55773	120 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	APOA5	Q6Q788	366 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF365	Q70YC5	407 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	KAT2B	Q92831	832 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	NEFL	P07196	543 aa		34.26	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	DGKD	Q16760	1214 aa		34.26	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	34.26	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		34.26	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	PPTC7	Q8NI37	304 aa		34.26	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		34.26	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		34.26	■■■■□ 3.08
CIZ1-209	ENST00000420484	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	PIK3CD	O00329	1044 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	MEIS2	O14770	477 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	TGFB3	P10600	412 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	CHMP4BP1	P59074	171 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	SP2	Q02086	613 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	KCNB2	Q92953	911 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	CUL5	Q93034	780 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	34.24	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	34.24	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		34.24	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	RASIP1	Q5U651	963 aa		34.24	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	34.24	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	COL6A3	P12111	3177 aa		34.23	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	34.23	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	34.23	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM161B	Q96MY7	647 aa		34.23	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	STAM2	O75886	525 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	GGPS1	O95749	300 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	34.22	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	34.22	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	SCLY	Q96I15	445 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	34.22	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	ZBTB43	O43298	467 aa		34.21	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	SORBS3	O60504	671 aa		34.21	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	HSPA4	P34932	840 aa		34.21	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	SESTD1	Q86VW0	696 aa		34.21	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	GUCD1	Q96NT3	240 aa		34.21	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	34.21	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		34.21	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	FGB	P02675	491 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	34.2	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	HERVK_113	Q902F9	699 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	SPATA33	Q96N06	139 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIZ1-209	ENST00000420484	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		34.2	■■■■□ 3.07

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