RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST5P78524 1137 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MBTPS1Q14703 1052 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 INF2Q27J81 1249 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM240Q5SV17 173 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PODNQ7Z5L7 613 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZAR1Q86SH2 424 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 DGKHQ86XP1 1220 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFHBQ8N7U6 833 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 C2orf69Q8N8R5 385 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXO41Q8TF61 875 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC5A5Q92911 643 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 KCNF1Q9H3M0 494 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 VTA1Q9NP79 307 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 OXSMQ9NWU1 459 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYO1BO43795 1136 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CFBP00751 764 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SYPP08247 313 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBP3P10745 1247 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCND1P24385 295 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRK2P25098 689 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRK3P35626 688 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRIK1P39086 918 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTF2A2P52657 109 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBM10P98175 930 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 LSAMPQ13449 338 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPA6Q8N4T0 437 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDIP1Q9H305 208 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TGM5O43548 720 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 WFS1O76024 890 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP27A1Q02318 531 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRY1Q16526 586 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 DDB1Q16531 1140 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MBLAC2Q68D91 279 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 OBP2AQ9NY56 170 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCFL5Q9UL49 500 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CBLCQ9ULV8 474 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM75PA6NK02 468 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 H7BY64 318 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D8O95759 1140 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 VCAM1P19320 739 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP2C19P33261 490 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADMP35318 185 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHC1P78364 1004 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCIRG1Q13488 830 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTF2H3Q13889 308 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TERF2Q15554 542 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS72Q15906 364 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GAB4Q2WGN9 574 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR158Q5T848 1215 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 BROXQ5VW32 411 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 RASSF3Q86WH2 238 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SVIPQ8NHG7 77 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D32Q96NH3 1257 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 BOCQ9BWV1 1114 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHST12Q9NRB3 414 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms