RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 F8W031 263 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 LAD1O00515 517 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GPSM2P81274 684 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 NELFCDQ8IXH7 590 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC170Q8IYT3 715 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MTMR8Q96EF0 704 aa15.64■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 NRAPQ86VF7 1730 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MYL1P05976 194 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 SLC16A2P36021 539 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CENPPQ6IPU0 288 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 DDX12PQ92771 950 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 AK8Q96MA6 479 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 UFL1O94874 794 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GALNT17Q6IS24 598 aa15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ESYT3A0FGR9 886 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RAD21O60216 631 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GNA11P29992 359 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 C8orf37Q96NL8 207 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ACBD3Q9H3P7 528 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CUEDC2Q9H467 287 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MED4Q9NPJ6 270 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 PLAGL2Q9UPG8 496 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TACC1O75410 805 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TUBB4BP68371 445 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RETREG2Q8NC44 543 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MTMR9Q96QG7 549 aa15.62■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEA1P43355 309 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 AMPD3Q01432 767 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MAP9Q49MG5 647 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 UNC13DQ70J99 1090 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 BAP1Q92560 729 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ANO9A1A5B4 782 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RPS6KA4O75676 772 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 FTCDO95954 541 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 PDHBP11177 359 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 AKR1B1P15121 316 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 KCNMA1Q12791 1236 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MAN2A1Q16706 1144 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RAD54LQ92698 747 aa15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1W2PQJ5 194 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ADCY7P51828 1080 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GSTO1P78417 241 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GRAPQ13588 217 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CERKQ8TCT0 537 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEF1Q9HAY2 307 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RHBDL3P58872 404 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 PPP4CP60510 307 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC181Q5TID7 509 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM58Q8NG06 486 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 MXD3Q9BW11 206 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 CD209Q9NNX6 404 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 E9PMD0 336 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 TLR2O60603 784 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 PACSIN1Q9BY11 444 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 RASSF4Q9H2L5 321 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-204ENST00000409937 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms