RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 TLK2Q86UE8 772 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 NECAB1Q8N987 351 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 SPC25Q9HBM1 224 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN3-201ENST00000395145 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 CTAGE5O15320 804 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 RGS20O76081 388 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 AP3B2Q13367 1082 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 TTLL4Q14679 1199 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 C6orf50Q9HD87 102 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 PHF24Q9UPV7 400 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.39■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ARIH2O95376 493 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 GNA11P29992 359 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ST3GAL1Q11201 340 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.38■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ALPK3Q96L96 1907 aa23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 MYADML2A6NDP7 307 aa23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ST18O60284 1047 aa23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 MCTP2Q6DN12 878 aa23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 PTGS1P23219 599 aa23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 BICD2Q8TD16 824 aa23.36■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 TGFB3P10600 412 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ICAM3P32942 547 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 KCNA10Q16322 511 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 GNPTABQ3T906 1256 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 AIFM3Q96NN9 605 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ANO3Q9BYT9 981 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ADAMTS3O15072 1205 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ACLYP53396 1101 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 LY6KQ17RY6 165 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 GNASQ5JWF2 1037 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 WASF1Q92558 559 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 COPS5Q92905 334 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM260Q9NX78 707 aa23.34■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 A0A1W2PQY0 241 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 GH1P01241 217 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 SREBF1P36956 1147 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 NLRP5P59047 1200 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 BEX3Q00994 111 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 GALNT17Q6IS24 598 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 PGBD1Q96JS3 809 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN3-201ENST00000395145 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 FIBPO43427 364 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 ZEB2O60315 1214 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 ASGR1P07306 291 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 CPT1AP50416 773 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGAP1Q07960 439 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 NPY5RQ15761 445 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 GPRASP2Q96D09 838 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.32■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 A6NJR5 290 aa23.31■■□□□ 1.32
CLDN3-201ENST00000395145 DTNBO60941 627 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms