RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 MYH4Q9Y623 1939 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 IDEP14735 1019 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 EHHADHQ08426 723 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 DDX12PQ92771 950 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 SEPT2Q15019 361 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MAP9Q49MG5 647 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 NEK11Q8NG66 645 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 CAPZA3Q96KX2 299 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF263O14978 683 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 C2CD5Q86YS7 1000 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 CUL5Q93034 780 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MACROD2A1Z1Q3 448 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 LCA5LO95447 670 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC96Q2M329 555 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 IQCEQ6IPM2 695 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 TMC4Q7Z404 712 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 PROM2Q8N271 834 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM58Q8NG06 486 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 CAGE1Q8TC20 777 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MMRN2Q9H8L6 949 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 DUSP10Q9Y6W6 482 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC55Q6ZSA7 311 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 TACC1O75410 805 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 GYS2P54840 703 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2SQ16763 222 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 KCNK18Q7Z418 384 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 EDEM3Q9BZQ6 932 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 VIPAS39Q9H9C1 493 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 VPS18Q9P253 973 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 HSP90B2PQ58FF3 399 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 COA1Q9GZY4 146 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 JRKLQ9Y4A0 524 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 EPHB6O15197 1021 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 KIF11P52732 1056 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 FAM71BQ8TC56 605 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 DEF6Q9H4E7 631 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 SH2D4AQ9H788 454 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 JADE2Q9NQC1 790 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MYOCDQ8IZQ8 938 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 SP8Q8IXZ3 490 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 HAS1Q92839 578 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MED4Q9NPJ6 270 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MARCH6O60337 910 aa29.26■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.26■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.26■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa29.26■■■□□ 2.28
HOXD13-201ENST00000392539 MYH10P35580 1976 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB5O15062 677 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 COASYQ13057 564 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 RRAGAQ7L523 313 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 NT5C3AQ9H0P0 336 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 SNX12Q9UMY4 172 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC53A6NM62 1247 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 AKR1B10O60218 316 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC41Q15345 812 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 ECM1Q16610 540 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 HYIQ5T013 277 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 BAP1Q92560 729 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC102AQ96A19 550 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 USP40Q9NVE5 1235 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 PRLRP16471 622 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 SHMT1P34896 483 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 LMAN1P49257 510 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 MTMR8Q96EF0 704 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 F8W031 263 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 RIMBP2O15034 1052 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF185O15231 689 aa29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms