RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380829.5

CLCN4-201, Transcript of chloride voltage-gated channel 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN4, Length 2,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4-201ENST00000380829 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 JDP2Q8WYK2 163 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 RAB34Q9BZG1 259 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.94■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 NRDCO43847 1150 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 POLD1P28340 1107 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CASQ1P31415 396 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PDIA5Q14554 519 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 MCM6Q14566 821 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 UBXN4Q92575 508 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 EGFRP00533 1210 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 STAT2P52630 851 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PDE4DQ08499 809 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KRT79Q5XKE5 535 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 EXOC1Q9NV70 894 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 TMX2Q9Y320 296 aa15.93■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 NFKBIEO00221 500 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 FCER1AP12319 257 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KRT31Q15323 416 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 SV2BQ7L1I2 683 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KCNK18Q7Z418 384 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 SRLQ86TD4 932 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 HPS3Q969F9 1004 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 GOPCQ9HD26 462 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PCDHA12Q9UN75 941 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 TBC1D8O95759 1140 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 AMPD3Q01432 767 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 STK4Q13043 487 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 ECM1Q16610 540 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 FAM83AQ86UY5 434 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 REXO1L1PQ8IX06 675 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 DNAI1Q9UI46 699 aa15.92■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 MYMKA6NI61 221 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 OPLAHO14841 1288 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 FANCGO15287 622 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 LMAN1P49257 510 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 ARHGAP4P98171 946 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 AP3B2Q13367 1082 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 DYMQ7RTS9 669 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 TC2NQ8N9U0 490 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 MTFR1LQ9H019 292 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 VPS16Q9H269 839 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 BCS1LQ9Y276 419 aa15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KCNJ18B7U540 433 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CAP2P40123 477 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 USP11P51784 963 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 STIM1Q13586 685 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KCNJ12Q14500 433 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CCDC174Q6PII3 467 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KIFC2Q96AC6 838 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 STK17AQ9UEE5 414 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PSMA7O14818 248 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 PRR16Q569H4 304 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 TMEM139Q8IV31 216 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 RAD54LQ92698 747 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 YY1AP1Q9H869 796 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 KCND1Q9NSA2 647 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.9■□□□□ 0.14
CLCN4-201ENST00000380829 N4BP3O15049 544 aa15.89■□□□□ 0.13
CLCN4-201ENST00000380829 TBC1D12O60347 775 aa15.89■□□□□ 0.13
CLCN4-201ENST00000380829 STAT3P40763 770 aa15.89■□□□□ 0.13
CLCN4-201ENST00000380829 GPS2Q13227 327 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms