RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378707.7

DMD-211, Transcript of dystrophin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene DMD, Length 7,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMD-211ENST00000378707 IL9RQ01113 521 aa7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 TCP10Q12799 353 aa7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 SULF1Q8IWU6 871 aa7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 LEMD2Q8NC56 503 aa7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 TRIM11Q96F44 468 aa7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.4□□□□□ -1.22
DMD-211ENST00000378707 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 M0R2C6 588 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 BUB1O43683 1085 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PSMA3P25788 255 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PLCD1P51178 756 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TMED2Q15363 201 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ELF2Q15723 593 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 LUZP2Q86TE4 346 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SH3GL1Q99961 368 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 A0A1B0GVL5 298 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PWP1Q13610 501 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 KRT72Q14CN4 511 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 MTBPQ96DY7 904 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 GALNT8Q9NY28 637 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.4□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 BIRC5O15392 142 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 NLRX1Q86UT6 975 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 CAPN10Q9HC96 672 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SMARCA2P51531 1590 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PEX1O43933 1283 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TOMM70O94826 608 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ULK4Q96C45 1275 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 MOCS3O95396 460 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PYGBP11216 843 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PDE6CP51160 858 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SLC16A1P53985 500 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ATP12AP54707 1039 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 INPP5DQ92835 1189 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TBK1Q9UHD2 729 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 POTEFA5A3E0 1075 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 DPYSL4O14531 572 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 RASGRF2O14827 1237 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SMC5Q8IY18 1101 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 C7orf31Q8N865 590 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 TSC22D3Q99576 134 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 SNX25Q9H3E2 840 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 KRT6AP02538 564 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 KRT6BP04259 564 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 KRT6CP48668 564 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PRDM2Q13029 1718 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 IFT88Q13099 833 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 RBBP7Q16576 425 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ACCSLQ4AC99 568 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PGBD3Q8N328 593 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.39□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ANXA13P27216 316 aa7.38□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 MSH2P43246 934 aa7.38□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 PAK1Q13153 545 aa7.38□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
DMD-211ENST00000378707 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms