RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 ASB14A6NK59 587 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 FAM86B1E9PN63 330 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 ZNF76P36508 570 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 ARHGEF6Q15052 776 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 ZNF174Q15697 407 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.47■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 B4DLN1 442 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 CYP3A7P24462 503 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 PDE4DQ08499 809 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 STXBP2Q15833 593 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 ARMCX2Q7L311 632 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 USP28Q96RU2 1077 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.46■■□□□ 1.35
NELFE-202ENST00000375429 ITGB5P18084 799 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MCM7P33993 719 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MBOAT7Q96N66 472 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 TINF2Q9BSI4 451 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CLIC4Q9Y696 253 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.45■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 RGS20O76081 388 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 IGHA2P01877 340 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CEP55Q53EZ4 464 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 TRIM17Q9Y577 477 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MEIS1O00470 390 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 SLC37A4O43826 429 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 IRF5Q13568 498 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 PRR16Q569H4 304 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 JADE2Q9NQC1 790 aa23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 STAM2O75886 525 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 LBX1P52954 281 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 ANO1Q5XXA6 986 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 LENG9Q96B70 501 aa23.43■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 Q4G0T1 1027 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 ATL3Q6DD88 541 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 TRIB2Q92519 343 aa23.42■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 ARP10275 920 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CYP2C19P33261 490 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 PRMT2P55345 433 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 POTEDQ86YR6 584 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 RAET1EQ8TD07 263 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 KATNBL1Q9H079 304 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.41■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 NEMFO60524 1076 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 PTGDRQ13258 359 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 PTPAQ15257 358 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 NLRX1Q86UT6 975 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 UIMC1Q96RL1 719 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CFAP45Q9UL16 551 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 ADCY3O60266 1144 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 ELNP15502 786 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 KRT85P78386 507 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 SEMA3FQ13275 785 aa23.4■■□□□ 1.34
NELFE-202ENST00000375429 MTMR1Q13613 665 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms