RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373193.7

PTPRT-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRT, Length 12,681 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-205ENST00000373193 ADA2Q9NZK5 511 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 MAP3K1Q13233 1512 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 AFPP02771 609 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 DEPDC1Q5TB30 811 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 PJA2O43164 708 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 GPAA1O43292 621 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 APOA1P02647 267 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 OCM2P0CE71 109 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 PKP1Q13835 747 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 DCTPP1Q9H773 170 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 KRT1P04264 644 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 H2AFZP0C0S5 128 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ATP2B4P23634 1241 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 FBXW4P57775 412 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 H2AFVQ71UI9 128 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 CCNYQ8ND76 341 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 IL16Q14005 1332 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 MMEP08473 750 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 DEPTORQ8TB45 409 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 KRT8P05787 483 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TSPYL6Q8N831 410 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TTI1O43156 1089 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 KRT17Q04695 432 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TIMM10P62072 90 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 CASP8Q14790 479 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ADCK1Q86TW2 530 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TLK1Q9UKI8 766 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 WDR47O94967 919 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 HSPA4LO95757 839 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 BBS9Q3SYG4 887 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 IQCDQ96DY2 449 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NLRP3Q96P20 1036 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 COQ7Q99807 217 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 MAPK4P31152 587 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 LIG4P49917 911 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NGLY1Q96IV0 654 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TMEM87BQ96K49 555 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 F5H423 210 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 DNM2P50570 870 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ME3Q16798 604 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 GIPC2Q8TF65 315 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ALDH1L1O75891 902 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 CA4P22748 312 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 SLC1A4P43007 532 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NDE1Q9NXR1 346 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NSMFQ6X4W1 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 FAM161BQ96MY7 647 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TNNC2P02585 160 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TMPRSS15P98073 1019 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 HPS4Q9NQG7 708 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ARAP1Q96P48 1450 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 HDAC4P56524 1084 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 KCTD6Q8NC69 237 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 CSRNP1Q96S65 589 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 DAPK1P53355 1430 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 PMLP29590 882 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ORC4O43929 436 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-205ENST00000373193 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms