RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN2AP68543 259 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 LMNB2Q03252 620 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GUCY2DQ02846 1103 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC41Q15345 812 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 MESDQ14696 234 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN26Q16670 478 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SUSD4Q5VX71 490 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 VCXQ9H320 206 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA8O94911 1581 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 MECOMQ03112 1051 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PTCH1Q13635 1447 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 IGBP1P78318 339 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 ABCD1P33897 745 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 EPSTI1Q96J88 318 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 RBL2Q08999 1139 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD2Q13200 908 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.131e-13■□□□□ 10.6
CCSAP-203ENST00000366687 NUF2Q9BZD4 464 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CDC25AP30304 524 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 NAA35Q5VZE5 725 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 PGBD1Q96JS3 809 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 COBLO75128 1261 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 CEP170P1Q96L14 293 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 DISC1Q9NRI5 854 aa22.08■■□□□ 1.13
CCSAP-203ENST00000366687 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 LARGE1O95461 756 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 KIF22Q14807 665 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 KCNQ4P56696 695 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 COA1Q9GZY4 146 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.08■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED6P86452 979 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 DPP9Q86TI2 863 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ZWINTO95229 277 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 FAM71BQ8TC56 605 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CNGA1P29973 690 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MAP7Q14244 749 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.07■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 FAM160B2Q86V87 743 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ATP1A2P50993 1020 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KA2Q15349 733 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CYP27B1O15528 508 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CDK8P49336 464 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC93Q567U6 631 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PARVGQ9HBI0 331 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 RNF14Q9UBS8 474 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF653Q96CK0 615 aa22.06■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PALLDQ8WX93 1383 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 H7C0C1 242 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ENC1O14682 589 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MCAMP43121 646 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5OP48047 213 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 KAZNQ674X7 775 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 SESTD1Q86VW0 696 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 AIFM3Q96NN9 605 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 NCAPD2Q15021 1401 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.05■■□□□ 1.12
CCSAP-203ENST00000366687 A6NJR5 290 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms