RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 NCAM2O15394 837 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TBX1O43435 398 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CBFA2T2O43439 604 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HOXC8P31273 242 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF460Q14592 562 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 BRD3Q15059 726 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FCHSD1Q86WN1 690 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TTC17Q96AE7 1141 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HPS5Q9UPZ3 1129 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MIA2Q96PC5 1412 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 FAM177BA6PVY3 158 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 DLX3O60479 287 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HIP1RO75146 1068 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SETSIPP0DME0 302 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CDK8P49336 464 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 WDR44Q5JSH3 913 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC89Q8N998 374 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CHMP3Q9Y3E7 222 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MYOM2P54296 1465 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SETD5Q9C0A6 1442 aa3.04□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 COL4A1P02462 1669 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRQ8 180 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RASSF10A6NK89 507 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 K7ENM7 598 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 M0R2C6 588 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ITKQ08881 620 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 HIF1AQ16665 826 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SLC6A16Q9GZN6 736 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZHX3Q9H4I2 956 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 IL21Q9HBE4 155 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV20A0A0B4J274 112 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CBX4O00257 560 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 WNT9AO14904 365 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LSSP48449 732 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MAN2A2P49641 1150 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CASP5P51878 434 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PICALMQ13492 652 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MAP3K11Q16584 847 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRD1Q6QNK2 874 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TPTE2Q6XPS3 522 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CYFIP1Q7L576 1253 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ATL2Q8NHH9 583 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 POF1BQ8WVV4 589 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM63Q969Q1 353 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 AXIN2Q9Y2T1 843 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 NUB1Q9Y5A7 615 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 TIAM2Q8IVF5 1701 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 UBR3Q6ZT12 1888 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 M0R3H8 397 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MTA2O94776 668 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 MAP3K6O95382 1288 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 CAP2P40123 477 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RPIAP49247 311 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 SIK1P57059 783 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ZBED6P86452 979 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 RBM10P98175 930 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 VWA5B2Q8N398 1253 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa3.03□□□□□ -1.92
CCSAP-202ENST00000366686 GCC1Q96CN9 775 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms