RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 GLI2P10070 1586 aa23.02■■□□□ 1.28
SMURF1-201ENST00000361125 MFAP3P55082 362 aa23.02■■□□□ 1.28
SMURF1-201ENST00000361125 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SMURF1-201ENST00000361125 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.02■■□□□ 1.28
SMURF1-201ENST00000361125 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SMURF1-201ENST00000361125 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.02■■□□□ 1.28
SMURF1-201ENST00000361125 ATP11AP98196 1134 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 TFDP1Q14186 410 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 HESX1Q9UBX0 185 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 EHHADHQ08426 723 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 KIF2CQ99661 725 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 NEDD4P46934 1319 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ENC1O14682 589 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 LPXNO60711 386 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MMP10P09238 476 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP25P42331 645 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CDC23Q9UJX2 597 aa23.01■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 AFPP02771 609 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 EPSTI1Q96J88 318 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ACCSQ96QU6 501 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 LAMC1P11047 1609 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 A2ML1A8K2U0 1454 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 GAP43P17677 238 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 Q3C1V9 767 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 VSIG1Q86XK7 387 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 FAM186BQ8IYM0 893 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CEP170P1Q96L14 293 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 GIPC1O14908 333 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PLCG1P19174 1290 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ITKQ08881 620 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R16BQ96T49 567 aa23■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 C21orf2O43822 256 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SLFN14P0C7P3 912 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MESDQ14696 234 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SLC35F6Q8N357 371 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 NCAPD2Q15021 1401 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 COA1Q9GZY4 146 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 NEDD9Q14511 834 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 NT5C1BQ96P26 610 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 RPS6KA4O75676 772 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 GNGT1P63211 74 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 FAM71BQ8TC56 605 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PAGE5Q96GU1 130 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.99■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 THAP12O43422 761 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SLC12A2P55011 1212 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PTK2Q05397 1052 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 NME8Q8N427 588 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 MASTLQ96GX5 879 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 LRRN2O75325 713 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 AOC3Q16853 763 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 KSR1Q8IVT5 923 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 NACC1Q96RE7 527 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB33Q86T24 672 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ALKQ9UM73 1620 aa22.98■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CABS1Q96KC9 395 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 ATP8B1O43520 1251 aa22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.97■■□□□ 1.27
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