RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 GRIN3BO60391 1043 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CDC25BP30305 580 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 GHRHRQ02643 423 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 COG2Q14746 738 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 WNK4Q96J92 1243 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 TRIM9Q9C026 710 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CSADQ9Y600 493 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 DSG3P32926 999 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 UBXN2AP68543 259 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 KCNB1Q14721 858 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SV2BQ7L1I2 683 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 MED15Q96RN5 788 aa21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 KLRC4O43908 158 aa21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ATP1A3P13637 1013 aa21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 SEMA3FQ13275 785 aa21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ECM1Q16610 540 aa21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 HYIQ5T013 277 aa21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.52■■□□□ 1.04
UPP1-201ENST00000331803 STAT3P40763 770 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RAD54LQ92698 747 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CDCA5Q96FF9 252 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 COL20A1Q9P218 1284 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 PARP14Q460N5 1801 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SLC26A4O43511 780 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 NF2P35240 595 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MCM6Q14566 821 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CEP55Q53EZ4 464 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 REPS2Q8NFH8 660 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.51■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RHOBTB3O94955 611 aa21.5■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 FANCCQ00597 558 aa21.5■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 KCNK18Q7Z418 384 aa21.5■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 IFNKQ9P0W0 207 aa21.5■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RLFQ13129 1914 aa21.5■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 OAZ1P54368 228 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RPTORQ8N122 1335 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ASIC1P78348 528 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SPATA1Q5VX52 437 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ERMNQ8TAM6 284 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 VAV3Q9UKW4 847 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 GDAQ9Y2T3 454 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RIPK3Q9Y572 518 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 STK24Q9Y6E0 443 aa21.49■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MYMKA6NI61 221 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MEIS1O00470 390 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 TPM3P06753 285 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ZNF18P17022 549 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 STX17P56962 302 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.48■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MED24O75448 989 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SERPINC1P01008 464 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 PRCPP42785 496 aa21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UPP1-201ENST00000331803 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms