RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 SREBF1P36956 1147 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 BTBD7Q9P203 1132 aa20.44■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 ADCY3O60266 1144 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CYP3A4P08684 503 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 RAB34Q9BZG1 259 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 ACAD9Q9H845 621 aa20.43■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 RNF146Q9NTX7 359 aa20.43■□□□□ 0.86
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SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTS3O15072 1205 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CYP3A7P24462 503 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP4P98171 946 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 FSIP1Q8NA03 581 aa20.42■□□□□ 0.86
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SYNE4-201ENST00000324444 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.42■□□□□ 0.86
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SYNE4-201ENST00000324444 OR52Z1P0C646 297 aa20.41■□□□□ 0.86
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SYNE4-201ENST00000324444 PLS1Q14651 629 aa20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 AK8Q96MA6 479 aa20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CTAGE5O15320 804 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 MARCH6O60337 910 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 KINO60870 393 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CCL5P13501 91 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 ELNP15502 786 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CIITAP33076 1130 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF76P36508 570 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 IRF5Q13568 498 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 RESP18Q5W5W9 173 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 RIPK3Q9Y572 518 aa20.4■□□□□ 0.86
SYNE4-201ENST00000324444 TBX3O15119 743 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 CCNA1P78396 465 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 CALCRLQ16602 461 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MBOAT7Q96N66 472 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 RNF208Q9H0X6 261 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 STK24Q9Y6E0 443 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 LCTP09848 1927 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PFASO15067 1338 aa20.39■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 NFIBO00712 420 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 Q4G0T1 1027 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 USP25Q9UHP3 1055 aa20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 B4DLN1 442 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 INHAP05111 366 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 ERVK-9P63128 1117 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 ERVK-24P63145 666 aa20.37■□□□□ 0.85
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SYNE4-201ENST00000324444 NSMFQ6X4W1 530 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 FAM20AQ96MK3 541 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 TIGD1Q96MW7 591 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MROH8Q9H579 483 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 DACT1Q9NYF0 836 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 GJB1P08034 283 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 SYKP43405 635 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 PDIA5Q14554 519 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 Q3C1V9 767 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 KANK3Q6NY19 840 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 SHC4Q6S5L8 630 aa20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYNE4-201ENST00000324444 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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