RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.52■■□□□ 1.68
VSTM4-201ENST00000298454 OFD1O75665 1012 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ICAM1P05362 532 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 VCAM1P19320 739 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF76P36508 570 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 TBX3O15119 743 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 EXOC1Q9NV70 894 aa25.51■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 MSH4O15457 936 aa25.5■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 UBXN2AP68543 259 aa25.5■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.5■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 HOOK2Q96ED9 719 aa25.5■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 CCZ1BP86790 482 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SEMA3FQ13275 785 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 HYIQ5T013 277 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 DYMQ7RTS9 669 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 CPXCR1Q8N123 301 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 FLOT1O75955 427 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 FCER1AP12319 257 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRAP18433 802 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 STK4Q13043 487 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 HPS3Q969F9 1004 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.49■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 POTEB3A0JP26 581 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 POTECB2RU33 542 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SKILP12757 684 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 POTEBQ6S5H4 581 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 FAM20AQ96MK3 541 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 WDR18Q9BV38 432 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PICK1Q9NRD5 415 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK1Q14185 1865 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GTH6 734 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 BACE1P56817 501 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 NR1I3Q14994 352 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 MED24O75448 989 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 USP14P54578 494 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 RNF181Q9P0P0 153 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.47■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 E9PMD0 336 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 NFIBO00712 420 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 STIM1Q13586 685 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 DDX12PQ92771 950 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 KLRG1Q96E93 195 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SYT17Q9BSW7 474 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SBF1O95248 1867 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 UNC13DQ70J99 1090 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.46■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PSMA7O14818 248 aa25.45■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 TEX33O43247 280 aa25.45■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 PRKG1Q13976 671 aa25.45■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 DLK2Q6UY11 383 aa25.45■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.45■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 VAV3Q9UKW4 847 aa25.45■■□□□ 1.67
VSTM4-201ENST00000298454 ALAS1P13196 640 aa25.45■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 HSD17B4P51659 736 aa25.45■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.45■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.45■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.45■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 COL20A1Q9P218 1284 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 POTEFA5A3E0 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 POTEIP0CG38 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 IDEP14735 1019 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8FQ08AF8 430 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.44■■□□□ 1.66
VSTM4-201ENST00000298454 POTEGQ6S5H5 508 aa25.44■■□□□ 1.66
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