RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 RETREG2Q8NC44 543 aa16.84■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ABCC12Q96J65 1359 aa16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 A6NNZ2 444 aa16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 PLS1Q14651 629 aa16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 ALX1Q15699 326 aa16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 SH2D4AQ9H788 454 aa16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PQC6 194 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CHUKO15111 745 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TTMPQ5BVD1 217 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GUA9 196 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 AGPSO00116 658 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 DNAJC7Q99615 494 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.83■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 EVX2Q03828 476 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MTRQ99707 1265 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SUFUQ9UMX1 484 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 UBE4AQ14139 1066 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CALCRLQ16602 461 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MAN2A1Q16706 1144 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 KLRF2D3W0D1 207 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TRAPPC10P48553 1259 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GNAQP50148 359 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TRADDQ15628 312 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.82■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 POTEMA6NI47 508 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PHF20L1A8MW92 1017 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 RPS6KA5O75582 802 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CREG2Q8IUH2 290 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PIGBQ92521 554 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 EPN3Q9H201 632 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MYH10P35580 1976 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 DDAH1O94760 285 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 GNA11P29992 359 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.81■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 NEFHP12036 1026 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MTMR8Q96EF0 704 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ALS2Q96Q42 1657 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TROAPQ12815 778 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SPATA20Q8TB22 786 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TBCKQ8TEA7 893 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CSF1RP07333 972 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SUSD4Q5VX71 490 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 SMIM5Q71RC9 77 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TRIM9Q9C026 710 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.8■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 EPHB6O15197 1021 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 PICALMQ13492 652 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 AMACRQ9UHK6 382 aa16.79■□□□□ 0.28
USP25-201ENST00000285679 TSKSQ9UJT2 592 aa16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms