RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 PTPAQ15257 358 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 TRAF1Q13077 416 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CASQ1P31415 396 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 INF2Q27J81 1249 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CPXCR1Q8N123 301 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 FSIP1Q8NA03 581 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 MEIS2O14770 477 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 TRAPPC10P48553 1259 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 GSDMDP57764 484 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 SLC39A14Q15043 492 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 REPS2Q8NFH8 660 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2B-201ENST00000265339 ZBED4O75132 1171 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 TTC38Q5R3I4 469 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ANO10Q9NW15 660 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ABCB11O95342 1321 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MYPNQ86TC9 1320 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SPTLC2O15270 562 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 FDX1P10109 184 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SNAPC2Q13487 334 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 PASKQ96RG2 1323 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.82■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MNS1Q8NEH6 495 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 YY1AP1Q9H869 796 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.81■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 TBCKQ8TEA7 893 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 HUNKP57058 714 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF174Q15697 407 aa22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SASH3O75995 380 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D5Q92609 795 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 DNAI1Q9UI46 699 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ALAS1P13196 640 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.79■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 PIK3CDO00329 1044 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GVL5 298 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 PPP6R2O75170 966 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 MCM7P33993 719 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SPRYD7Q5W111 196 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 NEK8Q86SG6 692 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SRLQ86TD4 932 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SDF4Q9BRK5 362 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.78■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 NFIBO00712 420 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D8O95759 1140 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 CFBP00751 764 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 OAZ1P54368 228 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 AP3B2Q13367 1082 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ANO3Q9BYT9 981 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 EPC1Q9H2F5 836 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 RIPK3Q9Y572 518 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 EDIL3O43854 480 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 LMAN1P49257 510 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 LETM2Q2VYF4 491 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 PNMA2Q9UL42 364 aa22.77■■□□□ 1.24
UBE2B-201ENST00000265339 ATP8B1O43520 1251 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 GTF2A2P52657 109 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 ICE2Q659A1 982 aa22.76■■□□□ 1.23
UBE2B-201ENST00000265339 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 177 ms