RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 CCDC42Q96M95 316 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 LAMB2P55268 1798 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 TRAF5O00463 557 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 AKR1B10O60218 316 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 FTCDO95954 541 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 SRGNP10124 158 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 SLC1A4P43007 532 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 ADCY7P51828 1080 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 CASP5P51878 434 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 KCNA1Q09470 495 aa9.65□□□□□ -0.86
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GINS1-201ENST00000262460 CALML4Q96GE6 196 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
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GINS1-201ENST00000262460 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.65□□□□□ -0.86
GINS1-201ENST00000262460 G3V3G9 751 aa9.65□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.65□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 HAS1Q92839 578 aa9.65□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.65□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.65□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 NDST4Q9H3R1 872 aa9.65□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 RSPH10BP0C881 870 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 JAG1P78504 1218 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SPAG1Q07617 926 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CEP112Q8N8E3 955 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC7Q99615 494 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 L1RE1Q9UN81 338 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CASZ1Q86V15 1759 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CHMP2AO43633 222 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 GNAQP50148 359 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 DNM2P50570 870 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PLS1Q14651 629 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 GJB7Q6PEY0 223 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.64□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CCDC151A5D8V7 595 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 GNA11P29992 359 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 GSTO1P78417 241 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PRR16Q569H4 304 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D5Q92609 795 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 MTMR8Q96EF0 704 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 LDHCP07864 332 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CAPN2P17655 700 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KIF11P52732 1056 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.875e-7■■■□□ 15.6
GINS1-201ENST00000262460 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 MTMR9Q96QG7 549 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 THAP9Q9H5L6 903 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC18Q9H819 358 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CLIC2O15247 247 aa9.63□□□□□ -0.87
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GINS1-201ENST00000262460 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SHMT1P34896 483 aa9.63□□□□□ -0.87
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GINS1-201ENST00000262460 SEPT2Q15019 361 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 VWA3BQ502W6 1294 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.63□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KCNMA1Q12791 1236 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 COASYQ13057 564 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 LLGL1Q15334 1064 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KRT79Q5XKE5 535 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.62□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 RGL1Q9NZL6 768 aa9.62□□□□□ -0.87
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