RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.37□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.37□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.37□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 PFASO15067 1338 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 FKTNO75072 461 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 GRIN1Q05586 938 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ZNF792Q3KQV3 632 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 TKFCQ3LXA3 575 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 DOCK5Q9H7D0 1870 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ARP10275 920 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 CDC25AP30304 524 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 MAP2K5Q13163 448 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SPECC1Q5M775 1068 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ARMCX2Q7L311 632 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 NEK8Q86SG6 692 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 CRYGNQ8WXF5 182 aa12.36□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ADCY6O43306 1168 aa12.35□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 STRNO43815 780 aa12.35□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ATP9AO75110 1047 aa12.35□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ZNF76P36508 570 aa12.35□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SREBF1P36956 1147 aa12.35□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.35□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SH3TC2Q8TF17 1288 aa12.35□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 NUCB2P80303 420 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SP2Q02086 613 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 AP3B2Q13367 1082 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 KIF22Q14807 665 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 TTC38Q5R3I4 469 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 GALNT17Q6IS24 598 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 OTOP1Q7RTM1 612 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 JMYQ8N9B5 988 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SAGE1Q9NXZ1 904 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 CDH23Q9H251 3354 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ARIH2O95376 493 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 TRAF1Q13077 416 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 PTGDRQ13258 359 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 LY6KQ17RY6 165 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 COPS5Q92905 334 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 LENG9Q96B70 501 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPA-201ENST00000260116 SLC15A5A6NIM6 579 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 GHRHRQ02643 423 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 PDE4DQ08499 809 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 SEMA3FQ13275 785 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 VSIG10LQ86VR7 867 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 RGS22Q8NE09 1264 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 USP6NLQ92738 828 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 CLIC6Q96NY7 704 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 SRRDQ9UH36 339 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 RPTORQ8N122 1335 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 CHMP2AO43633 222 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 ADCYAP1R1P41586 468 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 BRAPQ7Z569 592 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 RAET1EQ8TD07 263 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 TINF2Q9BSI4 451 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 PP2D1A8MPX8 630 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 FOSP01100 380 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 RGS2P41220 211 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 TXKP42681 527 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 MTMR1Q13613 665 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 IL17AQ16552 155 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 CEP55Q53EZ4 464 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 PCNX4Q63HM2 1172 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 APBA2Q99767 749 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 A0A087WWV3 80 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 POTEMA6NI47 508 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 NEMFO60524 1076 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 CNGA1P29973 690 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 COPB2P35606 906 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 STXBP2Q15833 593 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 RILPL1Q5EBL4 403 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 PLA2G4DQ86XP0 818 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 ABRAQ8N0Z2 381 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 DNERQ8NFT8 737 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 HAS1Q92839 578 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 PNMA2Q9UL42 364 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 MSH4O15457 936 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 ADCY3O60266 1144 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 EDNRBP24530 442 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 CCND2P30279 289 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPA-201ENST00000260116 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms