RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 MCM3P25205 808 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 TTC38Q5R3I4 469 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 EGFRP00533 1210 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 NELFBQ8WX92 580 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 NDUFA10O95299 355 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 ZNF543Q08ER8 600 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 MAP9Q49MG5 647 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 CALML3P27482 149 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 CNTNAP1P78357 1384 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.49■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 WNT10BO00744 389 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 GH2P01242 217 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 USP14P54578 494 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 NAPAP54920 295 aa22.48■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 CCDC96Q2M329 555 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 EFCC1Q9HA90 598 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 M0R2N6 131 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 PTGDRQ13258 359 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 E2F4Q16254 413 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 CHP1Q99653 195 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 RMND1Q9NWS8 449 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.48■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 RNF40O75150 1001 aa22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 ICA1Q05084 483 aa22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 FAM151AQ8WW52 585 aa22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.47■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 COA7Q96BR5 231 aa22.47■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.46■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.45■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.45■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.45■■□□□ 1.18
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VGF-201ENST00000249330 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 TNIP1Q15025 636 aa22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 SLFN13Q68D06 897 aa22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
VGF-201ENST00000249330 MMS19Q96T76 1030 aa22.44■■□□□ 1.18
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